原穴络穴输穴区别在于部位出处及主治的不同。

部位出处方面不同：原穴​主要在十二经脉腕、踝关节附近各有一个穴位，为脏腑原气经过和留止的部位，共有十二个穴位；络穴是络脉从本经别出部位的腧穴，十二经脉的络穴在四肢肘膝关节以下，加上任脉的鸠尾、督脉的长强、脾之大络大包，共有十五个络穴。

输穴为五输穴中的一种，多位于掌指或跖趾关节之后，共有十二穴位。

主治不同：原穴与脏腑之原气有着密切的联系，主要用于治疗相关脏腑的疾病；络穴既可治疗其络脉的病症，也可治疗表里两经的病症；输穴主要用于治疗关节疼痛等。

具体需由专业医生选穴操作，切勿自行盲目操作。